中央气象台14日早继续发布暴雨黄色预警和强对流天气蓝色预警，预计14日白天到夜间，广东中北部和东部沿海、广西东部、福建西南部、云南东部等地的部分地区有大暴雨，广东东部沿海局地有特大暴雨。上述部分地区伴有短时强降雨，并伴有雷暴大风等强对流天气。
受13日夜间至14日夜间广东多地大到暴雨天气影响，铁路部门对6月14日至15日京广铁路、京九铁路、杭深铁路部分列车采取停运措施。具体车次信息旅客可在12306网站查询，铁路部门后续将动态调整列车运行秩序，有出行需求的旅客应及时关注相关信息。
从13日夜间开始到14日白天，福建南平、三明、龙岩、漳州、厦门和宁德六市的大部，福州、泉州、莆田部分地区有暴雨或大暴雨，24小时累计雨量50—120毫米，局部可达200毫米，最大小时雨量90毫米。福建省防指13日20时启动防汛四级应急响应，要求各地各有关部门密切关注强降雨影响，扎实做好应对工作。
广西水利厅和广西气象局于13日16时联合发布山洪灾害气象预警：13日20时至14日20时，贺州市昭平县发生山洪灾害可能性很大；桂林市永福县，贺州市钟山县、平桂区发生山洪灾害可能性大；南宁市武鸣区，河池市大化瑶族自治县，桂林市平乐县发生山洪灾害可能性较大；百色市田林县、凌云县、平果市等地可能发生山洪灾害。提醒预警区域要密切关注降雨情况，注意做好监测、巡查、预警和转移避险。
交通运输部13日启动强降雨三级防御响应，紧盯强降雨密集地区和连续降雨高风险区域，加强调度，督促各地落实主动防御措施。
国家防总办公室、应急管理部组织多部门联合会商，研究部署重点地区防汛救灾工作。会商指出，13日起，南方正式进入降水集中期，江南南部至华南地区强降雨持续。会商要求，各地要加密偏远山区和夜间监测预报，加强气象预警与应急响应联动机制，及时启动应急响应，强化应急通信保障，提高断路、断网、断电情况下反应能力。国家防总维持针对广东、广西、江西、湖南、浙江、福建的防汛四级应急响应。